双方可以在谈判桌上商讨纠纷的具体事项并最终达成协议。可以通过相关行政部门的调解机构或者第三方中介机构进行调解，调解结果具有一定的法律效力。仲裁是通过指定的仲裁机构，由仲裁员对纠纷进行审理并作出裁决。法院将根据法律规定对纠纷进行审理，并根据事实和法律作出判决。法院的判决是终局判决，具有最终的法律效力。协商处理强调双方的合作和互谅互让，有助于维护双方的合作关系。诉讼处理具有公正、公平、权威的特点。
处理建筑工程合同纠纷的流程通常包括以下几个步骤：
1. 协商解决：双方当事人首先应通过协商的方式尝试解决纠纷。双方可以在谈判桌上商讨纠纷的具体事项并最终达成协议。
2. 调解处理：如果协商无果，双方可以申请调解。可以通过相关行政部门的调解机构或者第三方中介机构进行调解，调解结果具有一定的法律效力。
3. 仲裁解决：如果调解无效，双方可以选择申请仲裁。仲裁是通过指定的仲裁机构，由仲裁员对纠纷进行审理并作出裁决。仲裁裁决具有与法院判决相同的法律效力。
4. 诉讼解决：如果仲裁结果不满意，当事人可以选择将纠纷提交给法院进行诉讼解决。法院将根据法律规定对纠纷进行审理，并根据事实和法律作出判决。法院的判决是终局判决，具有最终的法律效力。
建筑工程纠纷处理的基本方法及特点如下：
1. 协商处理：协商是解决纠纷的最佳方式，可以有效保护双方的合法权益，而且费用较低。协商处理强调双方的合作和互谅互让，有助于维护双方的合作关系。
2. 调解处理：调解是一种主动的解决纠纷方式，调解员会倾听双方的诉求并寻找双方的共同利益点，帮助双方达成互利的协议。调解处理具有灵活性和高效性的特点。
3. 仲裁处理：仲裁是一种独立、公正、高效的纠纷解决方式。仲裁机构的裁决结果具有法律效力，双方可以选择仲裁的地点、仲裁员等，具有一定的自主性。
4. 诉讼处理：诉讼是一种追求法律公正的解决纠纷方式。法院对纠纷进行审理，可以调查事实、适用法律，并做出相应的判决。诉讼处理具有公正、公平、权威的特点。