内蒙古自治区的事实婚姻和同居关系之间的主要差异主要体现在法律地位、权利保障和财产分配等方面。夫妻在婚姻中享有的法律权利和义务，如夫妻名分、继承权、协议离婚、财产分割等，在事实婚姻中并不能得到法律保护，容易出现权益被侵犯的情况。但对于事实婚姻，没有法律依据来进行财产分配，双方的财产归属容易产生争议。
内蒙古自治区的事实婚姻和同居关系之间的主要差异主要体现在法律地位、权利保障和财产分配等方面。
1. 法律地位：事实婚姻是指未进行合法登记手续但具备夫妻关系的婚姻形式，而同居关系则是指未进行婚姻登记手续，仅仅以事实上一起生活的关系。在内蒙古自治区的法律上，事实婚姻并不被承认为合法婚姻，因此在法律地位上与同居关系有明显差异。
2. 权利保障：内蒙古自治区对于事实婚姻的权利保障相对较弱。夫妻在婚姻中享有的法律权利和义务，如夫妻名分、继承权、协议离婚、财产分割等，在事实婚姻中并不能得到法律保护，容易出现权益被侵犯的情况。而同居关系相对来说则没有法律保护，双方权益较为脆弱。
3. 财产分配：在内蒙古自治区的法律中，婚姻关系通常会给予夫妻双方一定的财产分配权。但对于事实婚姻，没有法律依据来进行财产分配，双方的财产归属容易产生争议。而同居关系并未受到法律保护，所以不存在财产分配的问题。
总结：内蒙古自治区事实婚姻和同居关系的主要差异主要在于法律地位、权利保障和财产分配等方面。事实婚姻没有法律地位和权利保障，而同居关系则没有法律保护和财产分配的问题。因此，在内蒙古自治区，事实婚姻的法律地位和权益保障相对较弱，同居关系也无法在法律上获得保护。