人民法院应当依据当事人的申请，对证明文件的真实性进行调查和处理。任何个人、法人或者其他组织对公证机构出具的公证文书真实性有异议的，可以向公证机构所在地的人民法院申请公证书真实性的核查，人民法院应予以调查。
出具证明文件重大失实案件是指在办理证明文件过程中，有关当事人、事实、条件、权利等方面的内容存在严重失实、虚假、不实的情况。为了维护证明文件的权威性、公信力，法律规定了以下重要规定：
1. 最高人民法院关于民事诉讼证明文件的解释第二十六条：任何个人、法人或者其他组织，对其所出具的诉讼证明文件真实性拒绝承认的，可向人民法院申请证明文件真实性。人民法院应当依据当事人的申请，对证明文件的真实性进行调查和处理。
2. 最高人民法院关于公证证明的若干规定第十四条：公证机构应当对公证活动中涉及的权利事项、事实、条件进行必要审查，确保证明文件的真实性和合法性。
3. 《公证法》第二十四条：未经验证的公证文书不具有证明力。任何个人、法人或者其他组织对公证机构出具的公证文书真实性有异议的，可以向公证机构所在地的人民法院申请公证书真实性的核查，人民法院应予以调查。
4. 《司法行政机关对申请执行人联第七号仲裁文书 等与执行行为有关的事项予以调查核实的若干规定》第四条：负责调查核实的人员必须查实案情、查实文书主体、查实事实、查实法律规定等，提供详细的调查核实情况，并按照规定出具调查核实报告。
这些规定对于出具证明文件重大失实案件的查证、核实、处理提供了明确的指导，旨在保障证明文件的真实性和公信力，维护当事人的合法权益。