可以选择劳动争议调解委员会或者由相关部门或组织协商调解。仲裁委员会将根据申请受理后的程序进行仲裁，并对仲裁结果做出决定。法院将根据法律规定进行审理，并作出判决。至于劳动纠纷能否约定管辖，根据劳动争议调解仲裁法的规定，劳动纠纷的管辖一般不能通过约定来改变。
劳动合同纠纷的管辖处理一般根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》进行处理，一般可以通过以下方式处理劳动合同纠纷的管辖：
1. 调解：当劳动合同纠纷发生时，双方可以协商、调解解决纠纷。可以选择劳动争议调解委员会或者由相关部门或组织协商调解。
2. 仲裁：如果通过调解无法解决合同纠纷，双方可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会将根据申请受理后的程序进行仲裁，并对仲裁结果做出决定。
3. 诉讼：如果通过仲裁仍然无法解决合同纠纷，双方可以向法院提起诉讼。法院将根据法律规定进行审理，并作出判决。
至于劳动纠纷能否约定管辖，根据劳动争议调解仲裁法的规定，劳动纠纷的管辖一般不能通过约定来改变。所以，一般情况下不能约定管辖。